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Artículo Original

Caracterización física y matemática de péptidos de alta unión de MSP-1 mediante la aplicación de la teoría de la probabilidad y la entropía

Javier R odríguez Velásquez

ARCHIVOS DE ALERGIA E INMUNOLOGÍA CLÍNICA 2008;(2):0074-0082 

Texto completo solo disponible en PDF

Introducción. MSP-1, proteína de superfi cie del merozoíto, es una proteína sintetizada durante el desarrollo del esquizonte e interactúa con el receptor de membrana del glóbulo rojo, por lo cual es una proteína implicada en el reconocimiento del merozoito al eritrocito.
Métodos. Se construyó un espacio de probabilidad no equiprobable que cuantifi ca la probabilidad de aparición de cada aminoácido en cada una de las veinte posiciones para 79 péptidos no sobrelapados de MSP-1. Con éste se calcularon los valores de probabilidad, sumatoria de probabilidad y entropía para estas secuencias, con el objetivo de diferenciar física y matemáticamente los péptidos de alta unión y no unión.
Resultados. Se encontró que los valores de sumatoria de probabilidad, de probabilidad y los de entropía para las secuencias específi cas comprobadas experimentalmente de alta unión varían entre los rangos asociados al macroestado unión, mientras que todos los valores (sumatoria de probabilidad, probabilidad o entropía) para todos los péptidos comprobados de no unión se encuentran fuera de los rangos asociados al macroestado de unión. Todos los péptidos de alta unión y baja unión fueron diferenciados acertadamente según estudios experimentales. La probabilidad, sumatoria de probabilidad y entropía diferencian las secuencias que se unen de las que no, acertando en el 100% de los casos estudiados.
Conclusión. Esta metodología es útil para caracterizar péptidos de alta unión en la proteína MSP-1 de una forma objetiva y reproducible, evidenciando que el fenómeno de unión de MSP-1 al merozoíto presenta un orden físico y matemático subyacente.


Palabras clave: probabilidad, entropía, eritrocito, MSP-1, alta unión,

Introduction. MSP-1, merozoite surface protein, is a protein synthesized during the development of the schizonte and interacts with the receiver of membrane of the red globule being a protein implied in the recognition from the merozoite to the eritrocyte.
Methods. A space of probability non equiprobability was built that quantifi es the probability of appearance of each amino acid in each one of the twenty positions for 79 peptides non overlapped of MSP-1, with this the values of probability, probability summation and entropy were calculated for these sequences, with the objective of diff ering physical and mathematically the peptides of high binding and non binders.
Results. It was found that the values of Probability summation, of Probability and those of Entropy for the specifi c sequences checked experimentally of high binding vary among the ranges associated to the binding macrostate, while all the values (probability summation, probability and entropy) for all the non binder peptides proven are outside of the ranges associated to the binding macrostate. All the peptides of high binding and non binders were diff erentiated wisely according to experimental studies. Th e probability, probability summation and entropy diff erentiate the binding sequences of those that not, guessing right in 100% of the studied cases.
Conclusions. Th is methodology is useful to characterize Peptides of high binding in the protein MSP-1 in an objective and reproducible way, evidencing that the phenomenon of binding of MSP-1 to the merozoite presents a physical and mathematical underlying order.


Keywords: probability, entropy, erythrocyte, MSP-1, high binding,


Los autores declaran no poseer conflictos de intereses.

Fuente de información Asociación Argentina de Alergia e Inmunología Clínica. Para solicitudes de reimpresión a Archivos de Alergia e Inmunología Clínica hacer click aquí.

Recibido | Aceptado | Publicado 2008-07-01

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Autores

Javier R odríguez Velásquez
Director Grupo de Investigación Insight, Investigador Centro de Investigaciones Clínica del Country. Correspondencia: Javier Rodríguez Velásquez. Dirección: Cra 84b # 51-16 Sur, Apartamento 102, Bogotá, Colombia..

Autor correspondencia

Javier R odríguez Velásquez
Director Grupo de Investigación Insight, Investigador Centro de Investigaciones Clínica del Country. Correspondencia: Javier Rodríguez Velásquez. Dirección: Cra 84b # 51-16 Sur, Apartamento 102, Bogotá, Colombia..

Correo electrónico: grupoinsight2025@yahoo.es

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Archivos de Alergia e Inmunología Clínica
Número 2 | Volumen 39 | Año 2008

Titulo
Caracterización física y matemática de péptidos de alta unión de MSP-1 mediante la aplicación de la teoría de la probabilidad y la entropía

Autores
Javier R odríguez Velásquez

Publicación
Archivos de Alergia e Inmunología Clínica

Editor
Asociación Argentina de Alergia e Inmunología Clínica

Fecha de publicación
2008-07-01

Registro de propiedad intelectual
© Asociación Argentina de Alergia e Inmunología Clínica

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